Zagrożeniem dla pobliskich lasów z biegiem czasu stały się również oddziały wojskowe stacjonujące i walczące na terenie wzgórza Trzy Lipki. Porastający pola las lipowy uległ znacznemu zniszczeniu w wyniku potyczek polsko-szwedzkich w roku 1645. Po odejściu wojsk na terenie wzgórza ostały się jedynie cztery lipy. Jedno z drzew zostało jednak zniszczone przez uderzenie pioruna w trakcie burzy, a trzy pozostałe lipy przyczyniły się do powstania nowej nazwy wzgórza “Trzy Lipki”.
